2021年12月省卫生健康委抽调了有关单位人员、聘请第三方机构组成专家组对委所属和联系单位内部控制建设情况开展了评价，评价结果分为优秀、良好、合格、基本合格、不合格5个等次，32家单位参与评审。根据评价情况，云南省中医医院成为被评定为“优秀等次”的9家单位之一。

根据《国家卫生健康委 国家中医药管理局关于印发公立医院内部控制管理办法的通知》（国卫规财务发〔2020〕31号）文件精神，云南省中医医院于2021年6月制定了《内部控制管理办法》，明确医院内部控制管理职责，并对单位层面和业务层面等内部控制重点内容等进行了细化，为医院后续内部控制管理工作的开展提供了方向与依据。近年来医院聘请第三方审计开展内控评价、风险评估和体系建设工作，形成内部控制手册并印发执行；在日常工作中注重以“评”促改，以“查”促改，查缺补漏，不断完善制度和工作流程，推动内控体系完善、健全。

不断完善内部控制体系建设，对医院提升单位内部管理水平、规范内部权力运行、促进依法行政、推进廉政建设具有重要意义。2022年，云南省中医医院将认真总结内部控制建设过程中取得的经验和不足，有针对性地开展工作，进一步推进内部控制信息化建设，将内部控制贯穿于医院整个经济业务活动中，促进医院内部控制体系构建的逐步完善。